Як відомо, дуже важко діагностувати і лікувати рак яєчників. Дане захворювання є смертельною хворобою. Виникає на тлі доброякісних і прикордонних новоутворень.
Дослідження, проведене вченими з Університету Каліфорнії, в Сан Дієго, школи медицини та онкологічного центру визначили шість мРНК ізоформ (біти генетичного матеріалу), які можуть бути використані для ранньої діагностики раку яєчників. Більш того, деякі з мРНК ізоформ - це код для унікальних білків, які можуть бути використані в якості нової цільової терапії.
Автор дослідження Крістіан Барретт (Christian Barrett), доктор філософії та експерт біоінформатики сказав: «наші дослідження спрямовані на використання ДНК для виявлення раку».
Згідно з дослідженнями, ДНК несе всі інструкції, необхідні для життя, її фактична послідовність містить набагато більше, ніж просто гени, що кодують білки. На противагу цьому, мРНК є додатковими копіями всіх генів. Вони несуть спеціальний рецепт для кожного білка, а клітини будуть створюватись з ядра в цитоплазму, де клітинний механізм зможе прочитати рецепт і побудувати відповідні білки. На думку авторів дослідження, використання раку мРНК є перевагою для ранньої діагностики. Ракова клітина може живити тільки один або кілька примірників мутації ДНК, але варіанти мРНК можуть відбуватися в сотнях тисяч копій на одну клітку.
Щоб визначити, як можна використовувати мРНК для того, щоб відрізнити рак яєчників клітини від нормальних клітин, команда розробила власний алгоритм біоінформатики і використання його для видобутку двох великих баз даних по генетичнії інформації. В одній з цих баз, The Cancer Genome Atlas (TCGA), є каталог РНК і ДНК від 500 пухлин, що охоплює багато видів раку, в той час як Genotype-Tissue Expression (Gtex) є базою даних ДНК і РНК, зразків нормальної тканини. З них, дослідники змогли проаналізувати дані про послідовність мРНК в 296 випадках раку яєчників і 1839 зразків нормальних тканин.
Використовуючи даний підхід, біоінформатики і вчені виділили шість мРНК ізоформ молекул, які мають свою специфіку пухлини, необхідну для раннього виявлення діагностики раку яєчників. Вони також підтвердили свої цифрові результати, використовуючи RT-кількісної ПЛР (полімеразної ланцюгової реакції, метод посилення гена), щоб виявити ті види раку яєчників, які містять конкретні молекули мРНК, вирощених в умовах лабораторії.
Крім діагностичних можливостей, деякі з мРНК ізоформ, ідентифікованих в даному дослідженні можуть також виступати в якості нових терапевтичних мішеней. За даними, ці мРНК ізоформи кодують білки з унікальними послідовностями амінокислот, які могли б дозволити їм податися на розвиток терапії, таких як моноклональні антитіла або вакцини Т-клітин. Більше того, рак яєчників і специфічні мРНК ізоформи, самі можуть бути спрямовані на створення нових терапевтичних препаратів.
Співавтор дослідження Шеріл Саєнс (Cheryl Saenz), доктор медичних наук і професор клінічної репродуктивної медицини, який спеціалізується на лікуванні гінекологічних ракових захворювань, сказав: «наші експериментальні висновки були зроблені в лабораторії тавиконані на клітинних лініях раку яєчників. Клінічні випробування повинні бути проведені на жінках, щоб підтвердити наявність цих маркерів ».
Автори дослідження визнають, що існують технічні обмеження у виявленні мРНК ізоформ, дефіциті нормальних зразків яєчників і фаллопієвих труб, а також можливості контролю, що пухлинні клітини, які поширюються в шийці матки, можуть діяти не за генетичним принципом.
На основі цих перспективних результатів, автори рекомендують розширити процес ідентифікації пухлини, специфічної мРНК ізоформи з 30 додаткових типів пухлин, для яких вже існує достатня кількість послідовності РНК.
Дане дослідження допомогли профінансувати Ірис і Метью Стросс (Iris and Matthew Strauss) з Сан-Дієго. Вони створили центр для раннього виявлення раку яєчників в пам'ять своєї дочки, Стефані Стросс (Stefanie Strauss).
Айріс Лінн Стросс стверджує, що центр створений для того, щоб допомогти іншим жінкам діагностувати цю жахливу і смертельну хворобу на ранніх стадіях.